为发挥产业技术创新战略联盟在引领和支撑产业技术创新中的重要作用，根据《国家技术创新工程总体实施方案》、《关于推动产业技术创新战略联盟构建与发展的实施办法（试行）》和《国家科技计划支持产业技术创新战略联盟暂行规定》精神，科技部于近期在国家科技支撑计划安排一定额度经费，支持联盟作为组织单位组织实施重大项目。
作为组织单位的联盟在科技部选择开展试点的联盟中选择，拟开展的项目应符合联盟协议书确定的技术创新方向和重点任务，着眼于构建产业技术创新链。有30多个试点联盟提成的项目建议通过立项可行性论证，预计国拨经费将超过20亿元。“十二五”期间，科技部将进一步深化国家科技计划管理改革，把产业技术创新战略联盟作为项目组织实施的重要载体。
